Pour certains de ses livres René Guitton a obtenu les prix suivants:
SI NOUS NOUS TAISONS – Le martyre des moines de Tibhirine (Calmann-Lévy 2001 / Pocket 2009)
- Prix Montyon de philosophie et de littérature de l’Académie Française « couronnant un livre qui oeuvre pour l’élévation morale ». (2001)
- Prix Lyautey de l’Académie des Sciences d’Outre-Mer "couronnant un livre qui œuvre pour le rapprochement entre les peuples" (2001)
- Prix Liberté (2001)
CES CHRETIENS QU’ON ASSASSINE (Flammarion 2009)
- Prix des Droits de l’Homme (2009)